Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ss18Q62280 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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