Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms