Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ssr4Q62186 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssr4Q62186 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssr4Q62186 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Ssr4Q62186 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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