Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms