Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrrn1Q61809 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrn1Q61809 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms