Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde3bQ61409 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms