Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf9Q61179 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms