Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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