Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp17laQ61068 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms