Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NinQ61043 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NinQ61043 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NinQ61043 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NinQ61043 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NinQ61043 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms