Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms