Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbbp4Q60972 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms