Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf3Q60803 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms