Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms