Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpdQ60668 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms