Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm1Q60636 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms