Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sema5bQ60519 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema5bQ60519 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms