Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a3Q5XF89 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a3Q5XF89 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a3Q5XF89 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a3Q5XF89 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a3Q5XF89 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms