Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms