Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdcp1Q5U462 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdcp1Q5U462 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms