Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms