Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms