Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd40Q5SUE8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms