Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms