Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TefmQ5SSK3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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