Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc85aQ5SP85 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms