Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PkdccQ5RJI4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PkdccQ5RJI4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PkdccQ5RJI4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms