Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eri2Q5BKS4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms