Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms