Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms