Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc3lQ4KL14 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms