Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5935Q497S0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms