Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms