Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms