Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Lrrc43Q3V0L5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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