Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnpc3Q3UZ01 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms