Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc114Q3UX62 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms