Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms