Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Obox3Q3UT54 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms