Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms