Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms