Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms