Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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