Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem253Q3UNB8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem253Q3UNB8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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