Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms