Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms