Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpr55Q3UJF0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms