Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp19Q3UJD6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp19Q3UJD6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp19Q3UJD6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp19Q3UJD6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Usp19Q3UJD6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp19Q3UJD6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Usp19Q3UJD6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Usp19Q3UJD6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Usp19Q3UJD6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Usp19Q3UJD6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Usp19Q3UJD6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Usp19Q3UJD6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp19Q3UJD6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms