Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms