Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms